Cells est composé de plusieurs modes, tous conçus autour de modèles réalistes d'organismes unicellulaires : RapidEvolution - Un jeu clicker/inactif dans une boîte de Pétri. Expérimentez en modifiant les conditions pour faire évoluer de nouveaux traits génétiques. Effectuez des tâches pour mettre à niveau vos outils de laboratoire. RapidEvolution Sandbox - Une simulation entièrement déverrouillée avec tous les traits génétiques et outils de laboratoire disponibles. Créez un flux de vie numérique en constante évolution sur votre bureau. Débloqué après avoir terminé RapidEvoultion. WinColumn - Créez une colonne Winogradsky couche par couche. Découvrez les nombreuses niches métaboliques occupées par les organismes unicellulaires. Une fois terminé, observez une « machine à mouvement perpétuel » métabolique sur votre bureau.