Le grand roi du slime et son armée attaquent le Japon, le pays est en état d'alerte et une seule personne peut le sauver, le ninja kawaii. Super kawaii ninja est un fps d'arène solo. Dans chaque niveau vous devrez sauver les habitants de la ville dans un temps imparti tout en combattant les ordres des slimes. Pendant le jeu, vous gagnerez de l'argent pour augmenter vos capacités. Au fur et à mesure que vous avancez dans le jeu, vous débloquerez de nouveaux niveaux et modes de jeu.