Halchemist merupakan game Metroidvania yang menceritakan kisah petualangan alkemis cilik "Dokter" dan golem tangan biru "Hando". Dokter melompat dan bergerak di sekitar peta, bergerak dan menyerang dengan cepat. Hando mampu melakukan serangan berat dan bebas melayang di udara untuk menjelajah. Di kerajaan Sophia Tiaka yang telah jatuh, terdapat potongan-potongan Pangenium yang berserakan, suatu zat yang konon dapat mengabulkan permintaan apa pun. Monster bos yang perkasa sedang menempati potongan pangenium, dan merupakan tujuan dokter dan hando untuk mengambil potongan pangenium dari mereka. Kerajaan menyembunyikan kemampuan dan item kuat yang akan membantu kedua karakter dalam perjalanan mereka. Karena pemain hanya dapat menangani satu jiwa, mereka akan bergantian mengendalikan dua karakter tersebut. Jelajahi dunia game ini, gunakan karakteristik berbeda dari kedua karakter untuk disesuaikan dengan eksplorasi dan pertarungan Anda.