Bumi telah dirusak oleh invasi dahsyat oleh ras alien bernama Vulkil. Kisah Anda dimulai pada tahun 2172 sebagai Spesialis tak dikenal di Olympia Prime, sebuah pangkalan yang terletak di bulan Bumi. Anda baru saja menjadi sukarelawan untuk berpartisipasi dalam prosedur eksperimental militer rahasia yang disebut Protokol ZOA. Sedikit yang diketahui tentang Protokol ZOA kecuali sebagian besar orang yang menjalaninya tidak dapat bertahan hidup. Mereka yang bertahan mengalami peningkatan kemampuan seperti kekuatan, daya tahan, kecepatan dan ketangkasan. Sebagai penyintas Protokol ZOA, Anda harus menggunakan kekuatan baru Anda untuk berpacu dengan waktu guna mengalahkan Vulkil, yang pada akhirnya menyelamatkan Bumi. Kisah permainan akan terungkap bab demi bab dan menyelamatkan Bumi akan mengharuskan Anda untuk menyita pesawat luar angkasa, mencari dan terbang ke planet Asing & menjalin atau menghancurkan aliansi dalam mencari cara untuk mengalahkan Vulkil.