Halchemist ialah permainan Metroidvania yang mengisahkan pengembaraan ahli alkimia kecil "Doktor" dan golem tangan biru "Hando". Doktor melompat dan bergerak mengelilingi peta, bergerak dan menyerang dengan pantas. Hando mampu melakukan serangan berat dan bebas terapung di udara untuk meneroka. Di kerajaan Sophia Tiaka yang jatuh, terdapat kepingan Pangenium yang bertaburan, bahan yang dikatakan dapat mengabulkan sebarang hajat. Raksasa bos yang perkasa sedang menduduki kepingan pangenium, dan adalah tujuan doktor dan hando untuk mendapatkan kepingan pangenium daripada mereka. Kerajaan menyembunyikan kebolehan dan barang yang berkuasa yang akan membantu kedua-dua watak dalam perjalanan mereka. Memandangkan pemain hanya boleh mengendalikan satu jiwa, mereka akan bergilir-gilir antara mengawal dua watak. Terokai dunia permainan ini, menggunakan ciri-ciri berbeza dua watak untuk disesuaikan dengan penerokaan dan pertempuran anda.