"Ejen Rahsia" ialah novel visual gaya Jepun yang dihasilkan oleh ensemble, pembangun novel visual percintaan Jepun. Cerita: Kebangkitan cinta ini sangat menggembirakan. Keluarga protagonis kami -- Mikage Jin -- adalah keturunan dari barisan ninja yang bertanggungjawab terhadap keselamatan negara sejak zaman Edo. Jin dilahirkan dan dibesarkan untuk mengikut jejak langkah ibu ejen rahsianya sebagai ninja dalam latihan. Dia telah diperintahkan untuk menyusup masuk ke Akademi Touka yang menyamar untuk menyelesaikan beberapa siri insiden daripada "Kelawar" yang mengaku dirinya sendiri. Setelah berjaya menyusup ke akademi dengan rakan AInya Momoka, dia dapat melaksanakan misinya tanpa menimbulkan syak wasangka, sambil mengeratkan persahabatannya dengan rakan sekelasnya Kanon Mayfield, kesatria Shirogane Kagura, kapten Renjouji Main, dan junior Amenomori Yui. Walau bagaimanapun disebabkan oleh kemalangan malang, identiti Jin terdedah, dan dengan identiti sebenarnya didedahkan, ia bermakna kegagalan untuk misinya, namun... Tolong jadikan saya ninja!! Adakah Jin masih mampu melaksanakan misinya?