"Secret Agent" là một tiểu thuyết trực quan theo phong cách Nhật Bản được sản xuất bởi Ensemble, một nhà phát triển tiểu thuyết trực quan lãng mạn của Nhật Bản. Câu chuyện: Sự thức tỉnh tình yêu này thật choáng ngợp. Gia đình của nhân vật chính của chúng ta - Mikage Jin - là hậu duệ của một dòng ninja chịu trách nhiệm về an ninh quốc gia kể từ thời Edo. Jin sinh ra và lớn lên để theo bước người mẹ đặc vụ bí mật của mình trở thành một ninja trong quá trình huấn luyện. Anh ta được lệnh bí mật thâm nhập vào Học viện Touka để giải quyết một loạt sự cố từ một "Người Dơi" tự xưng. Sau khi thâm nhập thành công vào học viện cùng với đối tác AI Momoka của mình, anh ấy có thể thực hiện nhiệm vụ của mình mà không gây nghi ngờ, đồng thời làm sâu sắc thêm tình bạn của mình với bạn cùng lớp Kanon Mayfield, hiệp sĩ Hirogane Kagura, đội trưởng Renjouji Main và đàn em Amenomori Yui. Tuy nhiên, do một tai nạn đáng tiếc, danh tính của Jin bị lộ và danh tính thực sự của anh bị lộ, điều đó đồng nghĩa với việc nhiệm vụ của anh sẽ thất bại, tuy nhiên... Hãy biến tôi thành ninja!! Liệu Jin vẫn có thể hoàn thành sứ mệnh của mình chứ?